呼吸系统为开放性器官，上呼吸道有多种常居菌寄生。被检标本要求晨起清水嗽口后，咯出呼吸道深处的痰液，或通过支气管镜直接取分泌物送检。痰细菌培养除普通培养外，厌氧菌和真菌等则需特殊培养基。由于杂菌混入机会较多，痰中检出的细菌不一定与疾病有关，有时还由于检查技术上的原因或病人已接受药物治疗，使有关的细菌受到抑制而查不出来。因此，应加强临床医生与细菌学检验工作者之间的密切联系，这种联系对于疾病的诊治是十分必要的。

　　【临床意义】

　　肺炎链球菌通常可引起大叶性肺炎，但也可致小叶性肺炎。近年来，由于抗生素的大量应用，耐药性金黄色葡萄球菌引起的肺炎有所增加；肺炎克雷伯氏菌，溶血性链球菌、流感嗜血杆菌引起的则较少见；少数肺炎也可由大肠埃希氏菌及军团病杆菌等革兰氏阴性杆菌引起。

　　中毒性肺炎多为肺炎链球菌引起。

　　新生儿肺炎、产前或产时感染者，以病毒、大肠埃希氏菌、铜绿色假单胞菌、变形杆菌为最常见；而产后感染者，则以金黄色葡萄球菌、链球菌、肺炎链球菌为多见。

　　肺脓肿是由多种化脓性细菌所引起，亦可由厌氧菌引起。

　　肺真菌病可检出各种真菌，其中以白色念珠菌和放线菌为多见。。