色甘酸钠临床用于预防过敏性哮喘的发作，疗效显著，可明显改善主观症状，且能增加病人对运动的耐受能力，减轻或安全抑制运动或换气过度所致的呼吸道阻力增加，也可见一秒钟最大呼吸量、肺活量显著增加，呼吸困难指数降低。对于依赖皮质激素的患者，服用本品后可使之减量或完全停用。对儿童疗效尤为显著，患有慢性难治性哮喘的儿童应用本品者大都部分或完全缓解。与异丙肾上腺素合用，较单用时有效率显著增高。但本品起效较慢，须连续用药数天后才能见效。如已发病，用药多无效。临床研究尚发现，色甘酸钠不仅对变态反应因素起主要作用的过敏性哮喘有效，对变态反应作用不明显的慢性哮喘也有效。据认为，在后一情况中是由于某些非过敏原性的因素导致肥大细胞脱颗粒所致，因而色甘酸钠的膜稳定作用对之有效。用于过敏性鼻炎和季节性枯草热，能迅速控制症状。口服和灌肠用于溃疡性结肠炎、溃疡性直肠炎也有一定疗效，不仅主观症状改善，而且乙状结肠镜检及直肠活检均见炎症及损伤显著减轻。软膏外用于慢性过敏性湿疹及某些皮肤瘙痒也见显著疗效。